中物联关于物流业营业税改征增值税试点情况的调研报告及政策建议(2)
货物运输业是充分竞争的行业，平均利润率只有3%左右。税负增加的结果，一方面进一步挤压企业利润，影响行业发展；一方面在自身难以消化的情况下，必然引起运价上涨，从而推高物价。这样的结果，显然有违《试点方案》中，关于“改革试点行业总体税负不增加或略有下降”的指导思想。2012年年初，上海市出台《关于实施营业税改征增值税试点过渡性财政扶持政策的通知》 （沪财税 [2012]5号），对上海市“营改增”试点过程中因新老税制转换而产生税负有所增加的试点企业实施过渡性财政扶持政策，也反映了部分行业税负增加较多的现实。但从长期来看，不能依靠过渡性财政扶持政策根本解决企业税负大幅增加的现实问题。
（二）物流业务各环节税率不统一问题仍未解决
我国现行营业税制度将物流业务划分为交通运输业与服务业两类税目，运输、装卸、搬运税率为3％，仓储、配送、代理等税率为5％。物流业务各环节税目不统一、税率不相同、发票不一致，是多年来困扰物流业发展的政策瓶颈。
为此，“国九条”明确指出：“要结合增值税改革试点，尽快研究解决仓储、配送和货运代理等环节与运输环节营业税税率不统一的问题。”而《试点方案》依旧对物流业设置了“交通运输服务”和“物流辅助服务”两类应税服务项目，交通运输服务按照11%的税率，物流辅助服务按照6%的税率征收增值税。
整合各类物流资源，实行供应链管理，一体化运作，开展一票到底业务、一站式服务，是物流企业基本的运作模式，也是客户普遍的服务要求。在实际经营中，各项物流业务上下关联，很难区分运输服务与物流辅助服务，人为划分不仅不适应现代物流一体化运作的需要，也增加了税收征管工作的难度。
（三）操作过程中还有一些具体问题亟待明确
一是快递企业适用税率仍不明确。在现行营业税体制下，由于对政策理解和掌握尺度不尽一致，各地基层税务机关对快递业营业税税目的认定上存在差异。分别有交通运输业、货代业、邮电通信业等3种不同的身份认定。征管标准不统一，是长期困扰快递企业的政策问题。但是由于在营业税体制下，税收差异不大，矛盾并未凸显。“营改增”试点后，试点地区税务机关实际操作中是依据原营业税纳税税目来确定试点纳税人。这次被认定为试点纳税人的快递企业，多数按照交通运输业纳税人对待，适用11%的增值税税率。有的快递企业不在试点范围之内，依旧按照邮电通信业缴纳营业税。这样，不仅造成同业间适用税目不一致，而且税负差异较大，导致同类企业税负不公。快递业属于劳动密集型企业，人力成本占总成本比重较高，可以抵扣的项目更少。如按交通运输业11%税率征收增值税，税负将大幅增加。
二是物流企业集团及其分、子公司无法合并缴纳增值税。《交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点实施办法》第七条规定：“两个或两个以上纳税人，经财政部和国家税务总局批准可以视为一个纳税人合并纳税。”2011年12月30日，财政部、国家税务总局发布《关于中国东方航空公司执行机构试点纳税人增值税计算缴纳暂行办法的通知》 （财税[2011]132号），允许中国东方航空公司及其分、子公司合并缴纳增值税。
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